Metody
| 
| 
Tabulka 1. Seznam použitých analytických metod.
|
Okruh |
Stanovovaná veličina |
Zkratka |
Vzorek |
Příprava analytu |
Postup stanovení |
Soubor map (rok) |
|
Fyzikální vlastnosti půd bramborových polí |
zrnitostní složení |
zrnitost |
volná půda
|
sušení |
standardní sada sít |
2010 |
|
pH půdy |
pH(KCl) |
výluh KCl |
SOP 44 |
2010 |
||
|
pH půdy |
pH(CaCl2) |
výluh CaCl2 |
SOP 44 |
2010 |
||
|
Kationtová výměnná kapacita |
KVK |
- |
SOP 78 |
2010 |
||
|
vodíkové ionty |
H+ |
- |
SOP 79 |
2010 |
||
|
Chemické vlastnosti půd bramborových polí |
organický uhlík |
Corg |
sušení, mletí |
analyzátor Vario MAX CNS (Elementar Analysensysteme, Hanau, Německo) |
2010 |
|
|
síra |
S |
2010 |
||||
|
dusík |
Ntot |
2010 |
||||
|
dusičnanový dusík |
N-NO3 |
- |
SOP 77 |
2010 |
||
|
fosfor |
Ptot |
extrakce v roztoku Mehlich III |
SOP 43 |
2010 |
||
|
vápník |
Ca |
SOP 42 |
2010 |
|||
|
hořčík |
Mg |
SOP 42 |
2010 |
|||
|
draslík |
K |
SOP 42 |
2010 |
|||
|
celkový organický uhlík |
rhizC |
tuberosféra
|
sušení, mletí |
analyzátor Vario MAX CNS |
2014 |
|
|
celkový dusík |
rhizN |
2014 |
||||
|
celková síra |
rhizS |
2014 |
||||
|
celkový fosfor |
rhizP |
rozklad lučavkou královskou |
Prvková analýza metodou ICP-OES |
2014 |
||
|
celkový vápník |
rhizCa |
2014 |
||||
|
celkový hořčík |
rhizMg |
2014 |
||||
|
celkové řelezo |
rhizFe |
2014 |
|
Biologicko-ekologické vlastnosti brambor a rhizosféry |
úroveň napadení obecnou strupovitostí |
StrL |
hlízy, letní odběr |
- |
vizuální hodnocení podle 9-stupňové škály |
2010 |
|
úroveň napadení obecnou strupovitostí
|
StrP |
hlízy, podzimní odběr |
- |
2010 |
||
|
diverzita mikrobiálního společenstva, počet taxonomických skupin aktinobakterií |
DivP |
volná půda |
extrakce půdní DNA |
TRFLP, primery 16Seu27F/ 16Sact1114R |
2010 |
|
|
počet taxonomických skupin aktinobakterií |
DivR |
tuberosféra |
2010 |
|||
|
Simpsonův index (1/D) |
DivS |
tuberosféra |
||||
|
Index Evenness (E) |
DivE |
tuberosféra |
2014 |
|||
|
fosfor |
Ptot |
periderm |
rozklad HNO3 a HClO4 |
FIA Lachat QC 8500 analyzátor (Lachat Instruments, Hach Company, Loveland, CO) |
2010 |
|
|
dusík |
Ntot |
periderm |
Kjeldahl, H2SO4, 360°C |
2010 |
||
|
vápník |
Catot |
periderm |
rozklad lučavkou královskou |
AAS spektrometr ContrAA 700 (Analytik Jena, Jena, Německo) |
2014 |
|
|
hořčík |
Mgtot |
periderm |
2014 |
|||
|
železo |
Fetot |
periderm |
2014 |
|
Kvantitativní poměry mikroorganismů bramborových polí |
Bakterie – celkové počty v půdě |
pudB |
tuberosféra |
extrakce půdní DNA |
kvantitativní PCR, primery EUB338F/ EUB518R |
2014 |
|
Aktinobakterie – celkové počty v půdě |
pudA |
tuberosféra |
extrakce půdní DNA extrakce DNA z peridermu |
kvantitativní PCR, Actino235/ EUB518R |
2014 |
|
|
Thaxtomin – počet kopii genu txtB v půdě |
pudT |
tuberosféra |
kvantitativní PCR, StrepF/ StrepR |
2014 |
||
|
Aktinobakterie – celkové počty ve slupce |
sluA |
kvantitativní PCR, Actino235/ EUB518R |
2014 |
|||
|
Thaxtomin – počet kopii genu txtB ve slupce |
sluT |
periderm |
extrakce DNA z peridermu |
kvantitativní PCR, StrepF/ StrepR |
2014 |